FDA 在指南中指出，“提交或持有 IND、NDA 或 BLA 的申办人和申请人必须遵守 FDA 有关向 FDA 提交与药物安全性和有效性相关的数据的要求。但这些规定是在广泛的动物或人类基因检测（例如，高通量 DNA 测序）或基因表达检测出现之前制定的，并没有具体描述此类数据作为一个单独的类别的提交要求。”
IND 申报
当药物基因组学研究结果支持在计划的临床试验的设计、实施或分析中使用基因组生物标志物时，IND 申办人必须向 FDA 提供详细报告。FDA 在指南草案中指出，“在这种情况下应提交详细报告，以促进对生物标志物临床有效性的审评，并确保使用生物标志物的试验有望达到既定目标。”
根据指南草案，这些详细报告应作为 IND 的一部分在先前人体经验部分、会议资料或临床研究方案或报告中提交。
NDA 和 BLA 申办人通常必须提交与 IND 申办人相同类型的药物基因组数据和研究，但申报要求的详细程度可能有所不同。例如，如果基因组生物标志物研究结果表明各亚组之间与疗效相关的应答存在显著差异，则需要为 NDA 或 BLA 提交详细报告。相反，IND 申报只要求提交概要。
当拟议将基因组生物标志物研究结果纳入标签时，NDA 和 BLA 申办人还必须提交一份包括受试者水平数据的详细报告。“这包括与为标签提供信息的药物基因组生物标志物有关的数据，因为这些数据与临床试验的患者选择（入组是否限于生物标志物或按生物标志物分层）、确定剂量和给药方式，或指导药物-药物相互作用（或缺乏相互作用）有关。此外，与特定临床建议无关的信息，如果与标签中的药物药代动力学分布或临床试验人群有关，也必须提交。”
